2006 lag der Schwerpunkt auf den Naturwissenschaften. Zu PISA 2006 liegen bislang nur die internationalen Ergebnisse vor. Die ersten nationalen Berichte mit den sprachregionalen und kantonalen Vergleichen werden Ende 2008 veröffentlicht. Der Anteil an Schweizer 15-Jährigen, welcher in den Naturwissenschaften das Kompetenzniveau 1 oder <1 erreicht, liegt im Vergleich zum OECD-Durchschnitt leicht unterhalb. In Finnland hingegen ist dieser Anteil sehr klein, dafür ist der Anteil der Hochkompetenten im Vergleich zur Schweiz sowie zum OECD-Durchschnitt doppelt so hoch.